NuBBEDB          

O NuBBE database (NuBBEDB) foi concebido pela Prof. Vanderlan S. Bolzani e Prof. Adriano D. Andricopulo, e desenvolvido como o resultado de uma sucedida colaboração entre os grupos de pesquisa "Núcleo de Bioensaios, Biossíntese e Ecofisiologia de Produtos Naturais" (NuBBE) da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (UNESP) e o Laboratório de Química Medicinal e Computacional (LQMC) da Universidade de São Paulo (USP). Os doutorandos Marília Valli (NuBBE, UNESP) e Ricardo N. Santos (LQMC, USP), com apoio da FAPESP, e a estudante de graduação Cíntia H. Nakajima estiveram ativamente envolvidos em todas as etapas do desenvolvimento do banco de dados. Todo o ambiente computacional incluindo o banco de dados foi criado e é mantido por Leandro Donaires Figueira.

NuBBE database (NuBBEDB) was conceived by Prof. Vanderlan S. Bolzani and Prof. Adriano D. Andricopulo, and developed as the result of a successful collaboration between the research groups "Nuclei of Bioassays, Biosynthesis and Ecophysiology of Natural Products" (NuBBE) of the "São Paulo State University (UNESP)" and "Laboratory of computational and Medicinal Chemistry" (LQMC) of the "University of São Paulo (USP)". The PhD students Marilia Valli (NuBBE, UNESP) and Ricardo N. Santos (LQMC, USP), with FAPESP fellowships, and the undergraduate student Cíntia H. Nakajima, were actively involved in all steps of the development of the database. The computational environment where the database is hosted was created and is maintained by Leandro Donaires Figueira.

O NuBBEDB é uma fonte atrativa de informação para a comunidade científica de produtos naturais e medicina química. É uma ferramente útil para estudos sobre compostos de ocorrência natural bioativa, propriedades moleculares e físicoquímicas, screening virtual, dereplicação, metabolômica, e para o design e síntese de compostos bioativos inovadores. O banco de dados compreende uma variedade de produtos naturais isolados pelo NuBBE e seus derivativos, assim como suas propriedades químicas e farmacológicas. Isto é também um esforço para tornar os produtos naturais acessíveis para screening virtual na comunidade acadêmica, com o formato de estrutura 3D compatível com as aplicações mais amplamente utilizadas.

NuBBEDB is an attractive source of information for the scientific community of natural products and medicinal chemistry. It is a useful tool for studies on naturally occurring bioactive compounds, molecular and physicochemical properties, database generation, virtual screening, dereplication, metabolomics, and for the design and synthesis of novel bioactive compounds. The database encloses a variety of natural products isolated in NuBBE and its derivatives, as well as the useful chemical and pharmacological properties of the compounds. This is also an effort to make natural products accessible for virtual screening in the academic community, with the 3D structure format compatible with the most widely used docking programs.

O NuBBEDB utiliza software das seguintes empresas:

NuBBEDB uses software from the following companies:

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Estas são as pessoas envolvidas na criação do NuBBEDB:

These are the people involved in the creation of NuBBEDB:

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Profa. Vanderlan da Silva Bolzani
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Prof. Adriano D. Andricopulo
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Marilia Valli
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Ricardo N. dos Santos
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Cíntia H. Nakajima
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Leandro D. Figueira

As 640 substâncias que deram origem ao NuBBEDB são resultantes dos trabalhos publicados pelos pesquisadores do NuBBE:

The 640 compounds that originated NuBBEDB came from the published work of the NuBBE researchers:

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Alberto José Cavalheiro
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Angela Regina Araujo
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Dulce Helena Siqueira Silva
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Ian Castro-Gamboa
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Marcia Nasser Lopes
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Maysa Furlan
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Vanderlan da Silva Bolzani

Atualmente, as seguintes estudantes de iniciação científica contribuem com a expansão de dados do NuBBEDB:

Currently, the following students contribute with the data expansion of NuBBEDB:

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Bianca Luany da Cunha
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Luisa Bortoletto
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Natália Felix
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Thais Kuriki